[スポンサーリンク]

一般的な話題

サイエンスアゴラの魅力を聞くー「日本蛋白質構造データバンク」工藤先生

[スポンサーリンク]

本間善夫先生からの紹介もいただいたため、サイエンスアゴラ出展の魅力を、日本蛋白質構造データバンク(PDBj)の工藤高裕先生にインタビューしました。来月11月9日・10日が待ち遠しくてわくわくしています。ケムステも参戦するサイエンスアゴラ2013開催の日です。当日の「ここがおもしろい!」をより詳しく発信します。

サイエンスアゴラとは、科学と社会をつなぐ科学コミュニケーション実践のための広場として、科学技術を活用してよりよい社会の実現を目指すイベントです。科学技術振興機構が主催になって開かれます。科学のお祭りです。今年2013年はケムステも参戦します(ケムステ記事「ケムステも出ます!サイエンスアゴラ2013」参照)。サイエンスアゴラでは、さまざまな人たちが集まって、科学を考え、語り合う「ひろば」となることを目指しています。開催方針には「伝えるとともにつくるへ広げる」という言葉がかかげられています。参加団体どうしのつながりをつくることを目的に、ケムステではインタビューをすることにしました。今回は2回目です。

2013agorapdbj1.png

 

そこで、サイエンスアゴラに参加の、日本蛋白質構造データバンク(PDBj)の工藤高裕先生に、インタビューをお願いしました。そして、ありがたいことに、ご快諾いただきました。たいへん感謝しています。ケムステ読者のみなさまにも、PDBjのウェブサイトでタンパク質をグリグリ動かして遊んだ経験があるという方が、きっと多いと思います。研究でよく利用しているという人もいるでしょう。では、工藤先生のお話をどうぞ!

 

どういう団体ですか?

生き物には生き物を特徴づけるような高分子(生体高分子)がたくさん見られます。そのような分子1つの詳細な「かたち」が分かると、その分子の機能解明につながったり、その分子に何らかの働きかけをする「くすり」の開発に役立ったりします。私たちPDBjProtein Data Bank Japan日本蛋白質構造データバンク)は、wwPDB(worldwide Protein Data Bank、国際蛋白質構造データバンク)という国際的な組織の下、米国RCSB PDB、英国PDBeなどと協力して生体高分子の「かたち」情報を集め、インターネット上で世界中の方に無償で提供する活動を行っています。

「データ」・「分子」という直接目に見えないものを扱う私たちの活動はなかなか一般には理解されにくい一面があるかもしれませんが、少しでも活動内容を知っていただき、興味を持っていただく一助となればと思い、昨年2012年に初めてサイエンスアゴラに出展させて頂きました。今年は昨年に続き2年目の出展となります。

会場では何が見どころですか?

昨年は立体視を使って視覚的に「分子」というものを体感していただく展示を行いましたが、実際触ることのできるものも併用できればより効果的かと考え、今年は北陸先端大の川上先生より分子の3Dモデルを拝借し、併せて出展することを考えています。みてさわって、何かちょっとでも「分子」という得体の知れなさそうなものに興味・関心を持っていただけたら幸いです。

ケムステについて思っていることや気になることがあればひとつお話しください。

時々ネット検索でケムステさんに行き当たることがあり、気にはなっておりました。私たちは特に非専門の方々への情報発信がまだまだ足らないと感じています。特にそういった面で参考にさせていただくと共に、こちらでできることがあればご協力させていただこうと思います。今後ともよろしくお願いします。

サイエンスアゴラで気になる団体を他にひとつ教えてください。

相互紹介のような形になってしまいますが、私たちを挙げていただきました日本コンピュータ化学会さんでしょうか。こちらの本間善夫先生の積極的な情報発信力と「生活環境化学の部屋」等の豊富なコンテンツには常々脱帽しており、今年はどんな出展をされるのか楽しみです。
もうひとつあげるとすれば、目にとまった出展のひとつ『うご図』アウトリーチプロジェクトさん(Aa-066)です。私たちPDBjが提供している分子構造データは、分子のある瞬間の「かたち」をとらえた「静的な」情報です。この情報だけでは実際の分子を知ったことにはなりません。なぜなら分子は目まぐるしく動き回って働く「動的な」ものだからです。しかしそれを伝えるコンテンツをどのようにして作るのかはなかなか難しいところで、何かいい方法がないか模索しています。何か参考になることがないか、出展を拝見するのを楽しみにしています。

文章:工藤高裕さん / 文字の色つけ等の整形:ケムステスタッフ

工藤先生、インタビューに、ご回答いただき、ありがとうございました。当日は、よろしくお願いします。

サイエンスアゴラ、おもしろそうでしょう。当日は、ケムステと両ブースに、化学好きならばゴーですよ。ご来訪、お待ちしています。

 

参考ウェブサイト

[1] 日本蛋白質構造データバンク – PDB Japan – PDBj (http://pdbj.org/)
[2] サイエンスアゴラAa-041たんぱく質のかたちを調べると何がわかるの?(http://www.jst.go.jp/csc/scienceagora/program/2693278339.html)

Avatar photo

Green

投稿者の記事一覧

静岡で化学を教えています。よろしくお願いします。

関連記事

  1. ご長寿化学者の記録を調べてみた
  2. 非常に小さな反転障壁を示す有機リン化合物の合成
  3. 浜松ホトニクスがケムステVプレミアレクチャーに協賛しました
  4. ケムステSlack、開設二周年!
  5. キラル超原子価ヨウ素試薬を用いる不斉酸化
  6. ケムステタイムトラベル2010 ~今こそ昔の記事を見てみよう~
  7. 学振申請書を磨き上げるポイント ~自己評価欄 編(後編)~
  8. プロドラッグの活性化をジグリシンが助ける

注目情報

ピックアップ記事

  1. 反応探索にDNAナノテクノロジーが挑む
  2. ジェニファー・ダウドナ Jennifer Doudna
  3. 自由の世界へようこそ
  4. ヘリウム新供給プロジェクト、米エアプロダクツ&ケミカルズ社
  5. ジイミド還元 Diimide Reduction
  6. アンモニアを用いた環境調和型2級アミド合成
  7. 【書籍】機器分析ハンドブック1 有機・分光分析編
  8. ハメット則
  9. 汝ペーハーと読むなかれ
  10. ケムステバーチャルプレミアレクチャーの放送開始決定!

関連商品

ケムステYoutube

ケムステSlack

月別アーカイブ

2013年10月
 123456
78910111213
14151617181920
21222324252627
28293031  

注目情報

最新記事

【太陽ホールディングス】新卒採用情報(2026卒)

■■求める人物像■■「大きな志と好奇心を持ちまだ見ぬ価値造像のために前進できる人…

産総研の研究室見学に行ってきました!~採用情報や研究の現場について~

こんにちは,熊葛です.先日,産総研 生命工学領域の開催する研究室見学に行ってきました!本記事では,産…

第47回ケムステVシンポ「マイクロフローケミストリー」を開催します!

第47回ケムステVシンポジウムの開催告知をさせて頂きます!第47回ケムステVシンポジウムは、…

【味の素ファインテクノ】新卒採用情報(2026卒)

当社は入社時研修を経て、先輩指導のもと、実践(※)の場でご活躍いただきます。「いきなり実践で…

MI-6 / エスマット共催ウェビナー:デジタルで製造業の生産性を劇的改善する方法

開催日:2024年11月6日 申込みはこちら開催概要デジタル時代において、イノベーション…

窒素原子の導入がスイッチング分子の新たな機能を切り拓く!?

第630回のスポットライトリサーチは、大阪公立大学大学院工学研究科(小畠研究室)博士後期課程3年の …

エントロピーの悩みどころを整理してみる その1

Tshozoです。 エントロピーが煮詰まってきたので頭の中を吐き出し整理してみます。なんでこうも…

AJICAP-M: 位置選択的な抗体薬物複合体製造を可能にするトレースレス親和性ペプチド修飾技術

概要味の素株式会社の松田豊 (現 Exelixis 社)、藤井友博らは、親和性ペ…

材料開発におけるインフォマティクス 〜DBによる材料探索、スペクトル・画像活用〜

開催日:10/30 詳細はこちら開催概要研究開発領域におけるデジタル・トランスフォーメー…

ロベルト・カー Roberto Car

ロベルト・カー (Roberto Car 1947年1月3日 トリエステ生まれ) はイタリアの化学者…

実験器具・用品を試してみたシリーズ

スポットライトリサーチムービー

PAGE TOP