メリフィールドペプチド固相合成法 Merrifield Solid-Phase Peptide Synthesis

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メリフィールドペプチド固相合成法 Merrifield Solid-Phase Peptide Synthesis

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ペプチド固相合成法(Solid-Phase Peptide Synthiesis, SPPS)は、ペプチド及びタンパク質を化学合成する一般的手法のひとつ。

直径0.1mm程度のポリスチレン高分子ゲルのビーズなどを固相として用い、ここにアミノ酸を結合させ、続けて縮合反応→末端の脱保護によって1つずつアミノ酸鎖を伸長していく。目的とするペプチドの配列が出来上がったら固相表面から切り出し、目的の物質を得る。バクテリア中で合成させることの難しいリボソームペプチドの合成や、D-アミノ酸、重原子置換体などの非天然アミノ酸の導入、ペプチド及びタンパク質主鎖の修飾なども可能である。

固相合成法は液相合成法(liquid-phase peptide synthesis, LPPS)と比較し、原料と縮合剤を洗い流すだけでよく簡便である。SPPSの開発により、それまで数十が限界であったペプチド合成を倍以上に伸ばすことに成功した。現在では、自動合成装置なども発達している。SSPS概念は、ペプチド以外にも、医薬品開発のコンビナトリアルケミストリーなどへと発展を遂げている。

本法を開発したRobert Merrifieldは、1984年のノーベル化学賞を受賞した。

基本文献

Merrifield, R. B. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2149. DOI:10.1021/ja00897a025
Fmoc method： (a) Chang, C.-D.; Meienhofer, J. Int. J. Pept. Protein Res. 1978, 11, 246. DOI: 10.1111/j.1399-3011.1978.tb02845.x (b) Gongora-Benitez, M.; Tulla-Puche, J.; Albericio, F. ACS Comb. Sci. 2013, 15, 217. DOI: 10.1021/co300153c
Coin, I.; Beyermann, M.; Bienert, M. Nat. Protoc. 2007, 2, 3247. doi:10.1038/nprot.2007.454

<LPPS>
Kisfaludy, L.; Schon, I.; XSzirtes, T.; Nyeki, O.; Low, M. Tetrahedron Lett. 1974, 15, 1785. doi:1785.10.1016/S0040-4039(01)82579-X
Anderson, L.; Blomberg, L.; Fiegel, M.; Lepsa, L.; Nilsson, B.; Verlander, M. J. Pept. Sci. 2000, 55, 227. [abstract]
Carpino, L. A.; Ghassemi, S.; Ionescu, D.; Ismail, M.; Sadat-Aalaee, D.; Truran, G.; Mansour, E. M.; Siwruk, G. A.; Eynon, J. S.; Morgan, B. Org. Process Res. Dev. 2003, 7, 28. DOI: 10.1021/op0202179
Eggen, I. F. Org. Process Res. Dev. 2005, 9, 98. DOI: 10.1021/op049864l

<Review of SPPS>

Amblard, M.; Fehrentz, J.-A.; Martinez, J.; Subra, G. Mol. Biotechnol. 2006, 33, 239.
Pattabiraman, V. R.; Bode, J. W. Nature 2011, 480, 471. doi:10.1038/nature10702

<Choice of Protective Group>

Isidro-Llobet, A.; Álvarez, M.; Albericio, F. Chem. Rev. 2009, 109, 2455. DOI: 10.1021/cr800323s

<General Review of Chemical Synthesis of Peptides/Proteins>

Humphrey, J. M.; Chamberlin, A. R. Chem. Rev. 1997, 97, 2243. DOI: 10.1021/cr950005s
Bray, B. L. Nat. Rev. Drug Discov. 2003, 2, 587. doi:10.1038/nrd1133
Nilsson, B. L.; Soellner, M. B.; Raines, R. T. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2005, 34, 91. DOI: 10.1146/annurev.biophys.34.040204.144700
Kent, S. B. H. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 338. DOI: 10.1039/b700141j
Pattabiraman, V. R.; Bode, J. W. Nature 2011, 480, 471. doi:10.1038/nature10702
Stolzew, S. C.; Kaiser, M. Synthesis 2012, 44, 1755. DOI: 10.1055/s-0031-1289765

反応機構

ペプチド鎖が高分子樹脂に固定されて隔てられていることから、それぞれのペプチド鎖が遠く、水素結合などで反応点がもぐりこむことによる反応性低下を防げる利点がある。

ペプチド結合形成反応そのものに関しては縮合剤の項目を参照。ペプチド合成はN-末端から伸長させていくのが定法である。C-末端から伸長させると、アズラクトン経由でα位のラセミ化が起こりやすく、好ましくない。

擬似的な高希釈条件が実現されているため、大環状ペプチドの合成にも効果的な方法論となる。

反応例

固相合成はN末アミノ酸の保護基によってFmoc法もしくはBoc法に分類される。これらカーバメート系保護基は穏和かつ選択的に除去可能であり、アミド型保護基に比してN-Hの酸性度が低く、エピメリ化が抑えられる利点もある。

中でもFmoc法が最良だと考えられている。側鎖を酸条件で除去可能な^tBu、Tr、Boc基などで保護し、N末を塩基性条件で除去可能なFmocで保護したアミノ酸単位を繋げていく。側鎖の脱保護はトリフルオロ酢酸(TFA)、フッ化水素酸(HF)によって行われる。

固相担体には直径20～100μmのレジンビーズが用いられる。用途に応じて適したものを選ぶ必要がある。よく使われるものを以下に示す。C末アミド型ペプチドの合成を行うにはRinkレジンを用いる。

実験手順

実験のコツ・テクニック

Fmocの脱保護は通常20%ピペリジン/DMFで行う。これでも完結しない場合は、DBU(1-5%)/ピペリジン(20%)/DMFで行うと良い。後者の条件ではAsp, Asn含有ペプチドには用いられない（アルパルトイミド化が進行するため）。
固相合成の溶媒はDMFかNMRが良く用いられるが、両溶媒は経時的に分解してアミン不純物を産生し、ペプチド合成汚染の原因になる可能性がある。AldraAmineパケットを溶媒に入れておくとをこれを簡便に除去でき、アミンフリー溶媒として用いることができる。
システインおよびヒスチジンの導入時にはラセミ化のリスクを伴う。システインの場合は硫黄原子のd軌道と脱プロトン化によって生じるカルバニオンが相互作用して安定化を受け、ラセミ化が促進されると考えられている[1]。この原理を踏まえ、嵩を小さくしてカップリング速度を増し、かつ電子供与性にしてd軌道の関与を抑えたMBom基[2]、Dpm基[3]が開発されている。ヒスチジンの場合は遊離π窒素が塩基として働くことが問題となる[4]。これを防ぐためにπ窒素をMBom基で保護する手法が開発されている[5]。

参考文献

Barber, M.; Jones, J. H.; Witty, M. J. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1979, 2425. DOI: 10.1039/P19790002425
Hibino, H.; Nishiuchi, Y. Org. Lett. 2012, 14, 1926. DOI: 10.1021/ol300592w
Góngora-Benítez, M.; Mendive-Tapia, L.; Ramos-Tomillero, I.; Breman, A. C.; Tulla-Puche, J.; Albericio, F. Org. Lett. 2012, 14, 5472. DOI: 10.1021/ol302550p
Isidro-Llobet, A.; Álvarez, M.; Albericio, F. Chem. Rev. 2009, 109, 2455. DOI: 10.1021/cr800323s
Hibino, H.; Nishiuchi, Y. Tetrahedron Lett. 2011, 52, 4947. doi:10.1016/j.tetlet.2011.07.065

外部リンク

ペプチド（Wikipedia日本）
ペプチド固相合成法（Wikipedia日本）
アミド（Wikipedia日本）
カルボジイミド（Wikipedia日本）
１－ヒドロキシベンゾトリアゾール（Wikipedia日本）
Peptide （Wikipedia）
Peptide Synthesis （Wikipedia）
Dicyclohexylcarbodiimide （Wikipedia）
Carbodiimide （Wikipedia）
PyBOP （Wikipedia）
Hydroxybenzotriazole （Wikipedia）
Condensation Reaction （Wikipedia）
最近の論文から～無保護のペプチド合成を目指して～（有機って面白いよね！）
DMT-MM (PDF; 和光純薬時報)
Steglich Esterification (organic-chemistry.org)
Ajiphase Peptide Synthesis
Solid Phase Peptide Synthesis (PDF, Bachem)
Peptide Guide (PDF, Bachem)

cosine

投稿者の記事一覧

博士(薬学)。Chem-Station副代表。国立大学教員→国研研究員にクラスチェンジ。専門は有機合成化学、触媒化学、医薬化学、ペプチド/タンパク質化学。
関心ある学問領域は三つ。すなわち、世界を創造する化学、世界を拡張させる情報科学、世界を世界たらしめる認知科学。
素晴らしければ何でも良い。どうでも良いことは心底どうでも良い。興味・趣味は様々だが、そのほとんどがメジャー地位を獲得してなさそうなのは仕様。

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